Акция
Блог
Процитировать
Печать
Электронная почта
ЗакладкаНаука Каждый День (13 января 2010) — университетские ученые Purdue привел усилие упорядочить геном сои, давая исследователям лучшее понимание генов завода и как использовать их, чтобы улучшить его особенности.
- Генетика
- Биология
- Эволюционная Биология
- Сельское хозяйство и Пища
- Биология Связанная с развитием
- Подвергаемые опасности Заводы
- Трансгенные заводы
- Вычислительный genomics
- Боб
- Генетически модифицированный организм
Профессор агрономии Скотт Джексон сказал, что американские министерства энергетики и исследование Сельского хозяйства нашли, что у сои есть приблизительно 46 000 генов, но многие из тех - 70 процентов к 80 процентам - являются дубликатами. Это дублирование может мешать предназначаться для генов, необходимых, чтобы улучшить особенности сои, такие как размер семени, нефтяное содержание или урожай.
Добавляя к трудности, Джексон сказал, что многие из дублированных генов в геноме сои были перетасованы, делая ее трудно, чтобы предсказать, где дубликаты гена могли бы быть. Это усложняет генетику и размножение сои.
"Если я выбираю для гена, у меня может быть трудность в расположении всех необходимых дубликатов того гена," сказал Джексон, соответствующий автор на работе генома сои, которая была опубликована в среду (13 января) на покрытии журнала Природа. "У этого есть много резервных копий."
Несмотря на трудности подарки генома сои, имея упорядоченный геном действительно убыстряются, ученые работы в состоянии сделать, чтобы улучшить особенности завода. Упорядочивающий геном избавляет от необходимости дотошные поиски специфических генов.
"Это действительно собирается изменить способ, которым мы задаем вопросы о сое в исследовании," сказал Рэнди Шоемэкер, генетик исследования от Службы сельскохозяйственных исследований американского Министерства сельского хозяйства в государственном университете Айовы и соавторе бумаги. "Что имело обыкновение брать нас буквально, годы могут взять нас недели или месяцы теперь. Это - весь генетический код перед Вами."
Мама Jianxin, доцент агрономии в Purdue и бумажном соавторе, сказала, что наибольшая пропорция генома сои составлена из взаимозаменяемых элементов, или TEs, которые часто упоминаются как 'геномное барахло. Однако, некоторые важны, сказала мама.
Взрывы деятельности от этих TEs, так же как их огромного присутствия, неизбежно оказывают влияние на функциональные возможности генов. Аннотация команды почти полного комплекта TEs в упорядоченном геноме привела к другому открытию относительно того, как TEs процветают в геноме хозяина, который будет издан в журнале Ячейка Завода в пятницу (15 января).
"Хотя TEs являются вездесущими, что мы обнаружили еще, не был замечен ни в каких других организмах," сказала мама. "Мы нашли, что некоторый 'мертвый' TEs может фактически быть повторно оживлен, обмениваясь с их активными партнерами TE, и таким образом восстановить или даже увеличивать их способность распространиться, используя машину увеличения, закодированную их партнерами."
Наличие генома в руке позволит ученым сравнивать различные варианты заводов сои и определять, какие гены ответственны за различные особенности, таковы как увеличенные нефтяные довольные или большие заводы. Один из следующих шагов в исследовании должен повторно упорядочить 20 000 линий сои в американской germplasm коллекции, чтобы найти гены не обычными для всех культурных сортов растения сои.
"Когда соя была одомашнена, они были отобраны для размера семени и других черт, но было много потенциально ценных оставленных позади генов," сказал Джексон. "Могут быть ценные гены, связанные с содержанием белка или сопротивлением болезни."
Объединенный Совет по Сое, Национальный научный фонд, USDA и Министерство энергетики финансировали исследование.
Источник Истории:
Приспособленный от материалов обеспечил университетом Purdue. Оригинальная статья, написанная Брайеном Валлхеимером.
Отметьте: Если никакому автору не дают, источник процитирован вместо этого.
Картография и Упорядочивание Генома Сои Прокладывают путь
к Улучшенным Зерновым культурам Сои 
Упорядоченный Геном Сои: Анализ Показывает Тропы для
Улучшения Biodiesel, Сопротивления Болезни, и Сокращения Ненужного Последнего тура 
Упорядоченный Геном Сои 