Акция
Блог
Процитировать
Печать
Электронная почта
ЗакладкаНаука Каждый День (29 января 2010) — Цитобиология в Экологической исследовательской группе Токсикологии в Отделе Цитобиологии Зоологии и Животного в университете Страны Басков (UPV/EHU) расшифровал transcriptome для серой кефали.
- Биология
- Биология Связанная с развитием
- Исследование Биохимии
- Генетика
- Цитобиология
- Эволюционная Биология
- Органоид
- Черта (биология)
- Вычислительный genomics
- Микромножество ДНК
Директор научно-исследовательской работы был Ibon Cancio.
Известно, что геном - библиотека, где вся информация каждого организма хранится. Эта информация организована в различных генах, где информация, чтобы синтезировать белки, которые выполняют большинство ячейки, функционирует, сохранен. У генома также есть другой тип генетического материала, который не находится в генах. Это - transcriptome - часть генома, который расшифрован или прочитан. В большинстве pluricellular организмов это - обычно более или менее 1.5 % генома.
Эта исследовательская группа UPV/EHU только что расшифровала transcriptome серой кефали. В течение многих лет теперь исследователи измеряли качество реки и морской воды. Для этого было необходимо иметь животное, способное к проживанию в загрязненных областях, одна из которых является серой кефалью. Цель состояла в том, чтобы измерить ответ, который это животное имеет к загрязнению, чтобы лучше знать качество окружающей воды. Кроме того, серая кефаль очень изобилует реками и морем Страны Басков. Таким образом, согласно Cancio, это - соответствующая модель животных, будучи очень богатым и способным к выживанию в загрязненных областях.
Больше чем половина генов
Исследование было начато в баскском рыбацком порту Ondarroa, собирая много серых кефалей: мужчины, женщины, молодая рыба, и т.д. Органы, такие как печень, ущелья, гонады и мозг были искоренены от каждого и извлеченной РНК посыльного. Эти образцы РНК посыльного были соответственно смешаны, чтобы гарантировать, что большинство transcriptome разновидностей будет найдено в полном образце. Впоследствии, РНК посыльного была преобразована в дополнительную ДНК.
Образцы дополнительной ДНК послали в упорядочивающий отдел в университете Ньюкасла в Великобритании. У этого университета есть новая упорядочивающая система, посредством чего, только с одним анализом, длящимся, семь с половиной часов, 400 000 cDNA, могут быть упорядочены, каждый с длиной 250 нуклеотидов. Это было то, как исследовательская группа UPV/EHU получила всю информацию о transcriptome серой кефали; 126 миллионов нуклеотидов, в бетоне.
Самая трудоемкая задача прибыла позже - понимающий всю информацию, полученную, то есть идентифицирующий гены для каждой последовательности, при условии, что функция последовательности может быть найдена из гена. К этому концу требовалась помощь от Общих Услуг Исследования (SGIker) UPV/EHU.
После этой процедуры были получены 18 332 гена. Цель не состояла в том, чтобы идентифицировать все гены серой кефали, но больше чем половину из них. Со всей этой информацией микрочип ДНК был развит, чтобы исследовать ответ упомянутых генов к загрязнению.
В течение наступающего года проблема для исследовательской группы UPV/EHU расшифровать transcriptome слизняка, чтобы произвести профиль здоровья почвы.
Источник Истории:
Приспособленный от материалов, обеспеченных Elhuyar Fundazioa.
Отметьте: Если никакому автору не дают, источник процитирован вместо этого.
Новые Томатные Заводы, Стойкие К Серой Форме, Должен
Уменьшить Использование Пестицида 
Это Началось С Писка: Серенада Лунного света Помогает
Помощникам Выбора Лемуров Правильных Разновидностей 