Наука Каждый День (5 февраля 2010) — Вместе с коллегами в Барселоне, исследователи в университете Северной Каролины в Холме Часовни произвели полную карту областей генома, которые управляют, какие гены "включены" или "прочь". Открытие, сделанное в панкреатических ячейках островка, открывает новые авеню для того, чтобы понять генетическое основание типа 2 диабета и другие распространенные болезни.
- Диабет
- Гены
- Персонифицированная Медицина
- Человеческая Биология
- Болезни и Условия
- Лимфома
- Человеческий Проект Генома
- Человеческий геном
- Генетика
- Микромножество ДНК
"Большая часть человеческого генома - неотмеченная на карте территория - все отрезки последовательности без ясной функции или цели," сказал Джейсон Либ, доктор философии, адъюнкт - профессор биологии в ПРОТОКОЛЕ INTERNET, члене ПРОТОКОЛА INTERNET ЛИНЕБЕРДЖЕРА Всесторонний Онкологический центр и один из старших авторов исследования. "Фактически, большинство последовательностей ДНК, связанных с болезнью, найденной к настоящему времени, не проживает в середине нигде. Здесь мы развили карту, которая может вести ученых в области генома, которые, действительно кажется, функционально относятся к делу, вместо тупика."
Исследование, изданное онлайн 31 января 2010, в Генетике Природы журнала, представляет первый атлас с высокой разрешающей способностью этих регулирующих элементов в наиболее изученном типе ячейки для обработки и предотвращения типа II диабета.
Завершение человеческого проекта генома поощрило волнение исследования относительно точных генетических изменений, лежащих в основе болезни. Но в то время как эти исследования обнаружили тысячи последовательностей, связанных с человеческой болезнью, точно определяя, какие изменения последовательности - истинные преступники, оказался трудным. Это - то, потому что основная генетическая последовательность - A, C, T, и Г, которые кодируют для Вашего всего, являющегося - являются только частью истории. Это не только сообщение, но и упаковка - вынуты ли те четыре письма как открытая книга или сильно упакованы как сообщение в бутылке - которые определяют, какие гены являются активными и которые не являются.
Используя новый метод, развитый в лаборатории Lieb под названием FAIRE-seq, Lieb и его коллеги изолировали и упорядочили в общей сложности 80 000 открытых участков хроматина в пределах панкреатических ячеек островка. Они тогда сравнили эти участки с теми в ячейках неостровка, чтобы сузить число к 3 300 группам участков, определенных для этого типа ячейки. Каждая группа типично охватывала единственные гены, которые являются активными определенно в ячейках островка. Двадцать из этих генов, как известно, питают генные варианты, связанные с типом II диабета.
Исследователи решили продолжить свои исследования варианта, наиболее настоятельно связанного с болезнью, единственным полиморфизмом нуклеотида - или SNP - происходящий в гене TCF7L2. Они нашли, что хроматин более открыт в присутствии версии высокого риска гена (T) чем в присутствии версии нериска (A). Дальнейший анализ продемонстрировал, что вариант риска увеличивал деятельность гена, указывая, что это может обладать функциональными особенностями, которые могли поспособствовать болезни.
Либ говорит, что его карта, вероятно, поможет другим в пределах диабета исследовать сообщество, идентифицируют новые цели для того, чтобы понять - и в конечном счете рассматривать - болезнь более эффективно. Но подход не ограничен диабетом, или даже панкреатическими ячейками островка. Он планирует использовать FAIRE-seq, чтобы картировать открытый подарок областей хроматина в пределах других ячеек, таких как лимфоциты иммунной системы.
Исследование ПРОТОКОЛА INTERNET финансировалось частично Национальными Институтами Здоровья. Учитесь среди соавторов от ПРОТОКОЛА INTERNET Кайл Дж. Голтон, Джереми М Саймона, Пола Г. Джирези, Мэри П. Фогарти, Тэми М. Пэнхуиса, Пайотра Микзковски, и Керэн Л. Мохлк. Сотрудники от внешнего ПРОТОКОЛА INTERNET включают Takao Nammo, Лоренсо Паскуали, Антонио Секки, Доменико Боско, Тьери Берни, Эдуарда Монтаниа, и Хорхе Феррера. Cо-старший автор доктор Феррер проводит свое исследование в Отделе Эндокринологии, Хоспитэла Клиника де Барселоны.
Источник Истории:
Приспособленный от материалов обеспечил университетом Школы Северной Каролины Медицины.
Отметьте: Если никакому автору не дают, источник процитирован вместо этого.
